read the xml database of
Файл, moldb.xml
<?xml version="1.0"7> <moldb>
<molecule> <name>Al am ne</name>
<symbol>ala</symbol> <code>A</code>
<type>hydrophobic</type> </molecule>
<molecule> <name>Lysine</name>
<symbol>lys</symbol> <code>K</code>
<type>cha rged</type> </molecule> </moldb>
Сценарий parsemoldb.php, интерпретатор файла moldb.xml:
<?php class AminoAcid { // класс аминокислот
var Sname; // aa имя var Ssymbol:
// трехбуквенный символ var Scode:
// однобуквенный код var Stype: // свойства
function AminoAcid ($aa) { foreach ($aa as $k=>$v)
Sthis->$k = $aa[$k]; } }
function readDatabase(Sfllename) {
// read the xml database of arrrinoacids
Sdata = implode("",file(Sfilename));
Sparser = xml_parser_create();
xml_parser_set_option
($parser.XML_OPTION_CASE_FOLDING,0):
xml_parser_set_option
($parser.XML_OPTION_SKIP_WHITE.l).
xml_parse_into_struct(Sparser,Sdata,&$values.&$tags),
xml_parser_free($parser).
// loop through the structures foreach
($tags as $key=>$val) { if ($key == "molecule")
{ $molranges = $val;
for ($i=0. $1 < count($molranges):
$1+=2) { Soffset = $molranges[$i] + 1;
$len = $molranges[$i + 1] - Soffset: $tdb[]
=
parseMol(array_slice($values. Soffset. Slen)): }
} else { continue: } } return $tdb: }
function parseMol($mvalues) {
for ($i=0; $1 < count($mvalues); $i++)
$mol[$mvalues[$i]["tag"]] = $mvalues[$i]["value"]:
return new AminoAcid($mol): }
$db = readDatabaseC'moldb.xml"):
echo "** Database of AminoAcid objects: ";
pnnt_r($db): ?>
После запуска сценария переменная $db будет содержать массив AminoAcid объектов и будет выведено:
** Database of AminoAcid objects: Array (
[0] => aminoacid Object (
[name] => Alamne [symbol] => ala [code] =>
A [type] => hydrophobic ) [1] => aminoacid Object
Содержание Назад Вперед
Forekc.ru
Рефераты, дипломы, курсовые, выпускные и квалификационные работы, диссертации, учебники, учебные пособия, лекции, методические пособия и рекомендации, программы и курсы обучения, публикации из профильных изданий